Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte
  • Thema der Doktorarbeit: "Agentenbasierte Modellierung von räumlich-zeitlichen Interaktionen zwischen Immunzellen und human-pathogenen Pilzen"
  • agentenbasierte Modellierung und Simulation von Wirt-Pathogen Interaktionen
  • Interaktion von Immunzellen und Candida albicans im menschlichen Blut
  • Migrationsdynamiken von Immunzellen in Folge von Pilzinfektionen
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2018 Wissenschaftliche Mitarbeiterin in der Gruppe Angewandte Systembiology am Hans-Knöll-Institut
2018 Dr. rer. nat. in Bioinformatik an der Friedrich-Schiller-Universität Jena
2013 M.Sc. in Bioinformatik an der Friedrich-Schiller-Universität Jena
2011 B.Sc. in Bioinformatik an der Friedrich-Schiller-Universität Jena

Publikationen

Lehnert T*, Leonhardt I*, Timme S, Thomas-Rüddel D, Bloos F, Sponholz C, Kurzai O, Figge MT#, Hünniger K# (2021) Ex vivo immune profiling in patient blood enables quantification of innate immune effector functions. Sci Rep 11(1), 12039.
Blickensdorf M, Timme S, Figge MT (2020) Hybrid agent-based modeling of Aspergillus fumigatus infection to quantitatively investigate the role of Pores of Kohn in human alveoli. Front Microbiol 11, 1951.
Blickensdorf M, Timme S, Figge MT (2019) Comparative assessment of aspergillosis by virtual infection modeling in murine and human lung. Front Immunol 10, 142.
Prauße MTE, Lehnert T, Timme S, Hünniger K, Leonhardt I, Kurzai O, Figge MT (2018) Predictive virtual infection modeling of fungal immune evasion in human whole blood. Front Immunol 9, 560.
Timme S, Lehnert T, Prauße MTE, Hünniger K, Leonhardt I, Kurzai O, Figge MT (2018) Quantitative simulations predict treatment strategies against fungal infections in virtual neutropenic patients. Front Immunol 9, 667.
Pollmächer J, Timme S, Schuster S, Brakhage AA, Zipfel PF, Figge MT (2016) Deciphering the counterplay of Aspergillus fumigatus infection and host inflammation by evolutionary games on graphs. Sci Rep 6, 27807.
Lehnert T*, Timme S*, Pollmächer J, Hünniger K, Kurzai O, Figge MT (2015) Bottom-up modeling approach for the quantitative estimation of parameters in pathogen-host interactions. Frontiers in Microbiology 6(608), *authors contributed equally.
Medyukhina A, Timme S, Mokhtari Z, Figge MT (2015) Image-based Systems Biology of Infection. Cytometry A 87(6), 462-470.