Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte
  • Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
  • Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
  • Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
seit 2011 Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI
2011-2021 Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena
2005-2010 Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt
2001-2005 Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL)
2000 Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL)
1995 Diplom in Physik an der Universität Dortmund
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten

Auszeichnungen

2011 - 2017 Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS)

Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen

seit 2021 Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication
seit 2019 Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics"
seit 2019 Herausgeber: Scientific Reports
seit 2017 Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie
seit 2017 PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget
seit 2017 Herausgeber: Cytometry A
seit 2015 Mitglied: Jena Center for Soft Matter
seit 2015 Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science
seit 2014 PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet
seit 2014 Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine
seit 2012 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB)
seit 2011 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI)
seit 2011 Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions
seit 2011 Mitglied: Jena School for Microbial Communication

Publikationen

Belyaev I*, Marolda A*, Praetorius JP, Sarkar A, Medyukhina A, Hünniger K, Kurzai O, Figge MT (2022) Automated characterisation of neutrophil activation phenotypes in ex vivo human Candida blood infections. Comput Struct Biotechnol J [Accepted]
Forster J, Streng A, Rudolph P, Rücker V, Wallstabe J, Timme S, Pietsch F, Hartmann K, Krauthausen M, Schmidt J, Ludwig T, Gierszewski D, Jans T, Engels G, Weißbrich B, Romanos M, Dölken L, Heuschmann P, Härtel C, Gágyor I, Figge MT, Kurzai O, Liese J (2022) Feasibility of SARS-CoV-2 surveillance testing among children and childcare workers at German Day Care Centers: A nonrandomized controlled trial. JAMA Netw Open 5(1), e2142057.
Goldmann M, Schmidt F, Cseresnyés Z, Orasch T, Jahreis S, Hartung S, Figge MT, von Lilienfeld-Toal M, Heinekamp T, Brakhage AA (2022) The lipid raft-associated protein stomatin is required for accumulation of dectin-1 in the phagosomal membrane and for full activity of macrophages against Aspergillus fumigatus. bioRxiv , 2022.02.25.481948.
Hoang TNM*, Cseresnyés Z*, Hartung S*, Blickensdorf M, Saffer C, Rennert K, Mosig AS, von Lilienfeld-Toal M, Figge MT (2022) Invasive aspergillosis-on-chip: A quantitative treatment study of human Aspergillus fumigatus infection. Biomaterials 283, 121420.
Hoffmann B*, Gerst R*, Cseresnyés Z, Fooc W, Sommerfeld O, Press AT, Bauer M, Figge MT (2022) Spatial quantification of clinical biomarker pharmacokinetics through deep learning-based segmentation and signal-oriented analysis of MSOT data. Photoacoustics 26, 100361.
Belyaev I, Praetorius J-P, Medyukhina A, Figge MT (2021) Enhanced segmentation of label-free cells for automated migration and interaction tracking. Cytometry A , 1-12.
Büttner H*, Niehs SP*, Vandelannoote K, Cseresnyés Z, Dose B, Richter I, Gerst R, Figge MT, Stinear TP, Pidot SJ, Hertweck C# (2021) Bacterial endosymbionts protect beneficial soil fungus from nematode attack. Proc Natl Acad Sci U S A 118(37), e2110669118.
Campagner A, Ciucci D, Svensson CM, Figge MT, Cabitza F (2021) Ground truthing from multi-rater labeling with three-way decision and possibility theory. Inf Sci 545, 771-790.
Kästner B, Hengoju S, Svensson CM, Figge MT, Rosenbaum MA (2021) Mit Tropfenmikrofluidik zu Hochgeschwindigkeits-Biotechnologie. BIOspektrum 27(3), 260-262. (Review)
Kühne M, Lindemann H, Grune C, Schröder D, Cseresnyés Z, Godmann M, Koschella A, Figge MT, Eggeling C, Fischer D, Heinze T*, Heinzel T*; * corresponding authors (2021) Biocompatible sulfated valproic acid-coupled polysaccharide-based nanocarriers with HDAC inhibitory activity. J Control Release 329, 717-730.