Polymikrobielle Gemeinschaften

Mikroorganismen, die in komplexen Lebensräumen wie dem Erdreich vorkommen, leben in ständiger Wechselwirkung miteinander. Unser Ziel ist es, die Wechselbeziehungen in polymikrobiellen Gemeinschaften und die Prozesse, die zur Ausprägung der funktionellen Fähigkeiten der Organismen führen, besser zu verstehen und sichtbar zu machen. Dafür nutzen wir die Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) und verschiedene FISH-Varianten, die uns zur Abbildung anderer Mikro-Eukaryoten wie Amöben, Algen und Pilzen dienen. Unser Fokus liegt dabei speziell auf folgenden Interaktionen:

  • mikrobielle Räuber-Beute-Gemeinschaften der Amöbe Dictyostelium discoideum und verschiedene Bakterien der Gattung Pseudomonas;
  • Wechselwirkungen zwischen Chlamydomonas und Bakterien;
  • Wechselwirkungen zwischen Bakterien und Pilzen.

Mitarbeiter*innen

Ying Huang
Rupali Sathe
Pierre Stallforth
Harikumar Suma
Mai Tran

Publikationen

Bando Y, Hou Y, Seyfarth L, Probst J, Götze S, Bogacz M, Hellmich UA, Stallforth P, Mittag M, Arndt HD* (2022) Total synthesis and structure correction of the cyclic lipodepsipeptide orfamide A. Chemistry 28(20), e202104417.
Zhang S, Mukherji R, Chowdhury S, Reimer L, Stallforth P (2021) Lipopeptide-mediated bacterial interaction enables cooperative predator defense. Proc Natl Acad Sci U S A 118(6), e2013759118.
Götze S, Stallforth P (2020) Structure, properties, and biological functions of nonribosomal lipopeptides from pseudomonads. Nat Prod Rep 37(1), 29-54. (Review)
Klapper M, Schlabach K, Paschold A, Zhang S, Chowdhury S, Menzel KD, Rosenbaum MA, Stallforth P (2020) Biosynthesis of pseudomonas-derived butenolides. Angew Chem Int Ed 59(14), 5607-5610.
Mukherji R, Zhang S, Chowdhury S, Stallforth P (2020) Chimeric LuxR transcription factors rewire natural product regulation. Angew Chem Int Ed 59(15), 6192-6195.
Braesel J, Götze S, Shah F, Heine D, Tauber J, Hertweck C, Tunlid A, Stallforth P, Hoffmeister D (2015) Three redundant synthetases secure redox-active pigment production in the basidiomycete Paxillus involutus. Chem Biol 22, 1325-1334.