Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte
  • Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
  • Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
  • Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
seit 2011 Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI
2011-2021 Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena
2005-2010 Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt
2001-2005 Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL)
2000 Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL)
1995 Diplom in Physik an der Universität Dortmund
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten

Auszeichnungen

2011 - 2017 Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS)

Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen

seit 2021 Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication
seit 2019 Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics"
seit 2019 Herausgeber: Scientific Reports
seit 2017 Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie
seit 2017 PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget
seit 2017 Herausgeber: Cytometry A
seit 2015 Mitglied: Jena Center for Soft Matter
seit 2015 Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science
seit 2014 PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet
seit 2014 Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine
seit 2012 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB)
seit 2011 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI)
seit 2011 Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions
seit 2011 Mitglied: Jena School for Microbial Communication

Publikationen

Dudeck J*, Medyukhina A*, Froebel J, Svensson C-M, Kotrba J, Gerlach M, Gradtke AC, Schröder B, Speier S, Figge MT**, Dudeck A**; *authors contributed equally; **corresponding authors, authors contributed equally (2017) Mast cells acquire MHCII from dendritic cells during skin inflammation. J Exp Med 214(12), 3791-3811.
Figge MT (2017) Systems Biology of Infection. In: NOVA ACTA LEOPOLDINA (ed.) Crossing Boundaries in Science. Documentation of the Workshop of the German National Academy of Sciences Leopoldina, Weimar, 06/30/2016-07/02/2016, 419, pp. 45-51.Wissenschaftliche Verlagsgesellschaft Stuttgart, Halle (Saale). ISBN: 978-3-8047-3758. (Review)
Hoffmann B*, Svensson C-M*, Straßburger M, Gebser B, Irmler IM, Kamradt T, Saluz HP, Figge MT, *authors contributed equally (2017) Automated quantification of early bone alterations and pathological bone turnover in experimental arthritis by in vivo PET/CT imaging. Sci Rep 7, 2217.
Klingberg A, Hasenberg A, Ludwig-Portugall I, Medyukhina A, Männ L, Brenzel A, Engel DR, Figge MT, Kurts C, Gunzer M (2017) Fully automated evaluation of total glomerular number and capillary tuft size in murine nephritic kidneys using lightsheet microscopy. J Am Soc Nephrol 28(2), 452-459.
Lehnert T, Figge MT (2017) Dimensionality of motion and binding valency govern receptor-ligand kinetics as revealed by agent-based modeling. Front Immunol 8, 1692.
Svensson C-M, Bondoc K G, Pohnert G, Figge MT (2017) Segmentation of clusters by template rotation expectation maximization. Comput Vis Image Underst 152, 64-72.
Svensson C-M*, Hoffmann B*, Irmler I, Straßburger M, Figge MT**, Saluz HP**; *authors contributed equally; **corresponding authors, authors contributed equally (2017) Quantification of arthritic bone degradation by analysis of 3D micro-computed tomography data. Sci Rep 7, 44434.
Buhlmann D*, Eberhardt HU*, Medyukhina A, Prodinger WM, Figge MT, Zipfel PF, Skerka C *authors contributed equally (2016) FHR3 Blocks C3d-Mediated Coactivation of Human B Cells. J Immunol 197(2), 620-629.
Pollmächer J, Timme S, Schuster S, Brakhage AA, Zipfel PF, Figge MT (2016) Deciphering the counterplay of Aspergillus fumigatus infection and host inflammation by evolutionary games on graphs. Sci Rep 6, 27807.
Brandes S, Mokhtari Z, Essig F, Hünniger K, Kurzai O, Figge MT (2015) Automated segmentation and tracking of non-rigid objects in time-lapse microscopy videos of polymorphonuclear neutrophils. Medical Image Analysis 20(1), 34-51.