(2020)
DeconvTest: Simulation framework for quantifying errors and selecting optimal parameters of image deconvolution.
J Biophotonics 13(4),
e201960079.
Prof. Dr. Marc Thilo Figge
Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.deCurriculum vitae
Forschungsschwerpunkte
- Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
- Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
- Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
| seit 2021 | Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena |
| seit 2011 | Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI |
| 2011-2021 | Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena |
| 2005-2010 | Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt |
| 2001-2005 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL) |
| 2000 | Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL) |
| 1995 | Diplom in Physik an der Universität Dortmund |
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten
Auszeichnungen
| 2011 - 2017 | Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) |
Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen
| seit 2021 | Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication |
| seit 2019 | Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics" |
| seit 2019 | Herausgeber: Scientific Reports |
| seit 2017 | Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie |
| seit 2017 | PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget |
| seit 2017 | Herausgeber: Cytometry A |
| seit 2015 | Mitglied: Jena Center for Soft Matter |
| seit 2015 | Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science |
| seit 2014 | PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet |
| seit 2014 | Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine |
| seit 2012 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB) |
| seit 2011 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI) |
| seit 2011 | Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions |
| seit 2011 | Mitglied: Jena School for Microbial Communication |
Publikationen
(2020)
Dynamic spherical harmonics approach for shape classification of migrating cells.
Sci Rep 10(1),
6072.
(2020)
Staphylococcus aureus lung infection results in down-regulation of surfactant protein-A mainly caused by pro-inflammatory macrophages.
Microorganisms 8(4),
577.
(2020)
Flotillin-dependent lipid-raft microdomains are required for functional phagolysosomes against fungal infections.
Cell Rep 32(7),
108017.
(2020)
Human neutrophils produce antifungal extracellular vesicles against Aspergillus fumigatus.
mBio 11(2),
e00596-20.
(2020)
Dynamic interplay of host and pathogens in an avian whole blood model.
Front Immunol 11,
500.
(2020)
Quantification of factor H mediated self versus non-self discrimination by mathematical modeling.
Front Immunol 11,
1911.
(2019)
Automated tracking of label-free cells with enhanced recognition of whole tracks.
Sci Rep 9(1),
3317.
(2019)
Comparative assessment of aspergillosis by virtual infection modeling in murine and human lung.
Front Immunol 10,
142.
(2019)
Enolase from Aspergillus fumigatus is a moonlighting and immune evasion protein that binds the human plasma complement proteins factor H, FHL-1, C4BP, and plasminogen.
Front Immunol 10,
2573.
