Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte
  • Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
  • Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
  • Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
seit 2011 Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI
2011-2021 Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena
2005-2010 Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt
2001-2005 Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL)
2000 Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL)
1995 Diplom in Physik an der Universität Dortmund
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten

Auszeichnungen

2011 - 2017 Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS)

Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen

seit 2021 Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication
seit 2019 Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics"
seit 2019 Herausgeber: Scientific Reports
seit 2017 Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie
seit 2017 PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget
seit 2017 Herausgeber: Cytometry A
seit 2015 Mitglied: Jena Center for Soft Matter
seit 2015 Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science
seit 2014 PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet
seit 2014 Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine
seit 2012 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB)
seit 2011 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI)
seit 2011 Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions
seit 2011 Mitglied: Jena School for Microbial Communication

Publikationen

Belyaev I, Praetorius J-P, Medyukhina A, Figge MT (2021) Enhanced segmentation of label-free cells for automated migration and interaction tracking. Cytometry A , 1-12.
Büttner H*, Niehs SP*, Vandelannoote K, Cseresnyés Z, Dose B, Richter I, Gerst R, Figge MT, Stinear TP, Pidot SJ, Hertweck C# (2021) Bacterial endosymbionts protect beneficial soil fungus from nematode attack. Proc Natl Acad Sci U S A 118(37), e2110669118.
Campagner A, Ciucci D, Svensson C-M, Figge MT, Cabitza F (2021) Ground truthing from multi-rater labeling with three-way decision and possibility theory. Inf Sci 545, 771-790.
Kästner B, Hengoju S, Svensson CM, Figge MT, Rosenbaum MA (2021) Mit Tropfenmikrofluidik zu Hochgeschwindigkeits-Biotechnologie. BIOspektrum 27(3), 260-262. (Review)
Lehnert T, Prauße MTE, Hünniger K, Praetorius J-P, Kurzai O, Figge MT (2021) Comparative assessment of immune evasion mechanisms in human whole-blood infection assays by a systems biology approach. PLOS One 16(4), e0249372.
Lehnert T*, Leonhardt I*, Timme S, Thomas-Rüddel D, Bloos F, Sponholz C, Kurzai O, Figge MT#, Hünniger K# (2021) Ex vivo immune profiling in patient blood enables quantification of innate immune effector functions. Sci Rep 11(1), 12039.
Muljajew I*, Huschke S*, Ramoji A, Cseresnyés Z, Hoeppener S, Nischang I, Foo W, Popp J, Figge MT, Weber C, Bauer M, Schubert US#, Press AT# (2021) Stealth effect of short polyoxazolines in graft copolymers: Minor changes of backbone end group determine liver cell-type specificity. ACS Nano 15(7), 12298-12313.
Press AT, Babic P, Hoffmann B, Müller T, Foo W, Hauswald W, Benecke J, Beretta M, Cseresnyés Z, Hoeppener S, Nischang I, Coldewey SM, Gräler MH, Bauer R, Gonnert F, Gaßler N, Wetzker R, Figge MT, Schubert US, Bauer M (2021) Targeted delivery of a phosphoinositide 3-kinase γ inhibitor to restore organ function in sepsis. EMBO Mol Med 13, e14436.
Sommerfeld O, Medyukhina A, Neugebauer S, Ghait M, Ulferts S, Lupp A, König R, Wetzker R, Schulz S, Figge MT, Bauer M, Press AT (2021) Targeting complement C5a receptor 1 for the treatment of immunosuppression in sepsis. Mol Ther 29(1), 338-346.
Stanford FA, Matthies N, Cseresnyés Z, Figge MT, Hassan MIA, Voigt K (2021) Expression patterns in reductive iron assimilation and functional consequences during phagocytosis of Lichtheimia corymbifera, an emerging cause of mucormycosis. J Fungi (Basel) 7(4), 272.