Prof. Dr. Marc Thilo Figge

Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.de

Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte

Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle

Wissenschaftlicher Werdegang

seit 2021	Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
seit 2011	Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI
2011-2021	Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena
2005-2010	Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt
2001-2005	Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL)
2000	Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL)
1995	Diplom in Physik an der Universität Dortmund

Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten

Auszeichnungen

2011 - 2017

Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS)

Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen

seit 2021	Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication
seit 2019	Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019	Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019	Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics"
seit 2019	Herausgeber: Scientific Reports
seit 2017	Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie
seit 2017	PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget
seit 2017	Herausgeber: Cytometry A
seit 2015	Mitglied: Jena Center for Soft Matter
seit 2015	Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science
seit 2014	PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet
seit 2014	Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine
seit 2012	Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB)
seit 2011	Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI)
seit 2011	Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions
seit 2011	Mitglied: Jena School for Microbial Communication

Publikationen

Battista M, Hoffmann B, Bachelot Y, Zimmermann L, Teuber L, Jost A, Linde S, Westermann M, Müller MM, Slevogt H, Hammerschmidt S, Figge MT, Vilhena C^*^#, Zipfel PF^*^# (2023) The role of pneumococcal extracellular vesicles on the pathophysiology of the kidney disease hemolytic uremic syndrome. mSphere 8(4), e0014223.

Details

Behrendt F^*, Cseresnyés Z^*, Gerst R, Gottschaldt M, Figge MT^#, Schubert US^# (2023) Evaluation of reproducible cryogel preparation based on automated image analysis using deep learning. J Biomed Mater Res A , 1-16.

Details

Foo WL, Cseresnyés Z, Rössel C, Teng Y, Ramoji A, Chi M, Hauswald W, Huschke S, Hoeppener S, Popp J, Schacher FH, Sierka M, Figge MT, Press AT^#, Bauer M^# (2023) Tuning the corona-core ratio of polyplex micelles for selective oligonucleotide delivery to hepatocytes or hepatic immune cells. Biomaterials 294, 122016.

Details

Gerst R^*, Cseresnyés Z^*, Figge MT^# (2023) JIPipe: Visual batch processing for ImageJ. Nat Methods 20(2), 168-169.

Details

Goldmann M, Schmidt F, Cseresnyés Z, Orasch T, Jahreis S, Hartung S, Figge MT, von Lilienfeld-Toal M, Heinekamp T, Brakhage AA (2023) The lipid raft-associated protein stomatin is required for accumulation of dectin-1 in the phagosomal membrane and for full activity of macrophages against Aspergillus fumigatus. mSphere 8(8), e0052322.

Details

González K^*, Gangapurwala G^*, Alex J^*, Vollrath A, Cseresnyés Z, Weber C, Czaplewska JA, Hoeppener S, Svensson CM, Orasch T, Heinekamp T, Guerrero-Sánchez C, Figge MT, Schubert US, Brakhage AA (2023) Targeting of phagolysosomes containing conidia of the human pathogenic fungus Aspergillus fumigatus with polymeric particles. Appl Microbiol Biotechnol 107(2-3), 819-834.

Details

Jia LJ, Rafiq M, Radosa L, Hortschansky P, Cunha C, Cseresnyés Z, Krüger T, Schmidt F, Heinekamp T, Straßburger M, Loeffler B, Doenst T, Lacerda JF, Campos A, Figge MT, Carvalho A, Kniemeyer O, Brakhage AA (2023) Aspergillus fumigatus hijacks human p11 to redirect fungal-containing phagosomes to non-degradative pathway. Cell Host Microbe 31(3), 373-388.

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Kühne M, Hofmann S, Lindemann H, Cseresnyés Z, Dzierza A, Schröder D, Godmann M, Koschella A, Eggeling C, Fischer D, Figge MT, Heinze T, Heinzel T (2023) Analysis of HDACi-coupled Nanoparticles: Opportunities and challenges. In: Humana, New York, NY (eds.) HDAC/HAT Function Assessment and Inhibitor Development. Methods in Molecular Biology 2589, pp. 129-144. Springer Protocols. ISBN: 978-1-0716-2787.

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Ma F, Kaufmann R, Sedzicki J, Cseresnyés Z, Dehio C, Hoeppener S, Figge MT, Heintzmann R^# (2023) Guided-deconvolution for correlative light and electron microscopy. PLOS One 18(3), e0282803.

Details

Orasch T^*, Gangapurwala G^*, Vollrath A, González K, Alex J, De San Luis A, Weber C, Hoeppener S, Cseresnyés Z, Figge MT, Guerrero-Sanchez C, Schubert US^#, Brakhage AA^# (2023) Polymer-based particles against pathogenic fungi: A non-uptake delivery of compounds. Biomater Adv 146, 213300.

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