(2023)
Tuning the corona-core ratio of polyplex micelles for selective oligonucleotide delivery to hepatocytes or hepatic immune cells.
Biomaterials 294,
122016.

Prof. Dr. Marc Thilo Figge
Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.deCurriculum vitae
Forschungsschwerpunkte
- Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
- Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
- Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 | Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena |
seit 2011 | Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI |
2011-2021 | Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena |
2005-2010 | Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt |
2001-2005 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL) |
2000 | Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL) |
1995 | Diplom in Physik an der Universität Dortmund |
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten
Auszeichnungen
2011 - 2017 | Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) |
Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen
seit 2021 | Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication |
seit 2019 | Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
seit 2019 | Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
seit 2019 | Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics" |
seit 2019 | Herausgeber: Scientific Reports |
seit 2017 | Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie |
seit 2017 | PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget |
seit 2017 | Herausgeber: Cytometry A |
seit 2015 | Mitglied: Jena Center for Soft Matter |
seit 2015 | Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science |
seit 2014 | PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet |
seit 2014 | Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine |
seit 2012 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB) |
seit 2011 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI) |
seit 2011 | Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions |
seit 2011 | Mitglied: Jena School for Microbial Communication |
Publikationen
(2023)
JIPipe: Visual batch processing for ImageJ.
Nat Methods
[Accepted]
(2023)
The lipid raft-associated protein stomatin is required for accumulation of dectin-1 in the phagosomal membrane and for full activity of macrophages against Aspergillus fumigatus.
mSphere
[Accepted]
(2023)
Re-direction of phagosomes to the recycling expulsion pathway by a fungal pathogen.
bioRxiv
[Preprint]
(2023)
Analysis of HDACi-coupled nanoparticles: Opportunities and challenges.
In: Humana, New York, NY (eds.) HDAC/HAT Function Assessment and Inhibitor Development. Methods in Molecular Biology 2589, pp. 129-144. Springer Protocols.
ISBN: 978-1-0716-2787. (Review)
(2022)
Automated characterisation of neutrophil activation phenotypes in ex vivo human Candida blood infections.
Comput Struct Biotechnol J 20,
2297-2308.
(2022)
Acceptance of different self-sampling methods for semiweekly SARS-CoV-2 testing in asymptomatic children and childcare workers at German Day Care Centers: A nonrandomized controlled trial.
JAMA Netw Open 5(9),
e2231798.
(2022)
Feasibility of SARS-CoV-2 surveillance testing among children and childcare workers at German Day Care Centers: A nonrandomized controlled trial.
JAMA Netw Open 5(1),
e2142057.
(2022)
Targeting of phagolysosomes containing conidia of the human pathogenic fungus Aspergillus fumigatus with polymeric particles.
Appl Microbiol Biotechnol ,
1-16.
(2022)
Invasive aspergillosis-on-chip: A quantitative treatment study of human Aspergillus fumigatus infection.
Biomaterials 283,
121420.