(2023)
The role of pneumococcal extracellular vesicles on the pathophysiology of the kidney disease hemolytic uremic syndrome.
mSphere 8(4),
e0014223.

Prof. Dr. Marc Thilo Figge
Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.deCurriculum vitae
Forschungsschwerpunkte
- Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
- Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
- Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 | Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena |
seit 2011 | Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI |
2011-2021 | Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena |
2005-2010 | Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt |
2001-2005 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL) |
2000 | Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL) |
1995 | Diplom in Physik an der Universität Dortmund |
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten
Auszeichnungen
2011 - 2017 | Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) |
Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen
seit 2021 | Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication |
seit 2019 | Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
seit 2019 | Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
seit 2019 | Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics" |
seit 2019 | Herausgeber: Scientific Reports |
seit 2017 | Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie |
seit 2017 | PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget |
seit 2017 | Herausgeber: Cytometry A |
seit 2015 | Mitglied: Jena Center for Soft Matter |
seit 2015 | Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science |
seit 2014 | PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet |
seit 2014 | Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine |
seit 2012 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB) |
seit 2011 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI) |
seit 2011 | Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions |
seit 2011 | Mitglied: Jena School for Microbial Communication |
Publikationen
(2023)
Evaluation of reproducible cryogel preparation based on automated image analysis using deep learning.
J Biomed Mater Res A ,
1-16.
(2023)
Tuning the corona-core ratio of polyplex micelles for selective oligonucleotide delivery to hepatocytes or hepatic immune cells.
Biomaterials 294,
122016.
(2023)
JIPipe: Visual batch processing for ImageJ.
Nat Methods 20(2),
168-169.
(2023)
The lipid raft-associated protein stomatin is required for accumulation of dectin-1 in the phagosomal membrane and for full activity of macrophages against Aspergillus fumigatus.
mSphere 8(8),
e0052322.
(2023)
Targeting of phagolysosomes containing conidia of the human pathogenic fungus Aspergillus fumigatus with polymeric particles.
Appl Microbiol Biotechnol 107(2-3),
819-834.
(2023)
Aspergillus fumigatus hijacks human p11 to redirect fungal-containing phagosomes to non-degradative pathway.
Cell Host Microbe 31(3),
373-388.
(2023)
Analysis of HDACi-coupled Nanoparticles: Opportunities and challenges.
In: Humana, New York, NY (eds.) HDAC/HAT Function Assessment and Inhibitor Development. Methods in Molecular Biology 2589, pp. 129-144. Springer Protocols.
ISBN: 978-1-0716-2787.
(2023)
Guided-deconvolution for correlative light and electron microscopy.
PLOS One 18(3),
e0282803.
(2023)
Polymer-based particles against pathogenic fungi: A non-uptake delivery of compounds.
Biomater Adv 146,
213300.