Prof. Dr. Marc Thilo Figge

Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.de

Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte

Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bild- und Spektroskopiedaten
Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle

Wissenschaftlicher Werdegang

seit 2021	Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
seit 2011	Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI
2011-2021	Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena
2005-2010	Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt
2001-2005	Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL)
2000	Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL)
1995	Diplom in Physik an der Universität Dortmund

Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten

Auszeichnungen

2011 - 2017

Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS)

Ämter und wissenschaftliche Aktivitäten

seit 2023	Vorstandsmitglied und Koordinator des Aufgabenbereichs “Bioimage Informatics” in der von der DFG geförderten nationalen Initiative zur Verwaltung von Forschungsdaten “NFDI4Bioimage”
seit 2023	Vorstandsmitglied und PI in der DFG-Research Training School RTG 2723 – “Materials-Microbes-Microenvironments”
seit 2023	Vorstandsmitglied des Beutenberg Campus e.V. “Life Science meets Physics”
seit 2023	Herausgeber: PLOS Complex Systems
seit 2023	Herausgeber: Biological Imaging
seit 2022	Koordinator von Basic Technology 3 in dem vom BMBF geförderten “Leibniz Center for Photonics in Infection Research”
seit 2022	Koordinator des vom BMBF geförderten "Multi-Model-Simulator Project” in der Förderlinie “Computational Life Sciences”
seit 2021	Stellvertretender Koordinator der "Jena School for Microbial Communication"
seit 2019	Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019	Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019	Sprecher und PI des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics"
seit 2019	Herausgeber: Scientific Reports
seit 2017	Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie
seit 2017	PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget
seit 2017	Herausgeber: Cytometry A
seit 2015	Mitglied: Jena Center for Soft Matter
seit 2015	Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science
seit 2014	PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet
seit 2012	Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB)
seit 2011	Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI)
seit 2011	Fakultätsmitglied und PI in der "International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions"
seit 2011	Fakultätsmitglied und PI in der "Jena School for Microbial Communication"

Publikationen

Sommerfeld O, Medyukhina A, Neugebauer S, Ghait M, Ulferts S, Lupp A, König R, Wetzker R, Schulz S, Figge MT, Bauer M, Press AT (2021) Targeting complement C5a receptor 1 for the treatment of immunosuppression in sepsis. Mol Ther 29(1), 338-346.

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Stanford FA, Matthies N, Cseresnyés Z, Figge MT, Hassan MIA, Voigt K (2021) Expression patterns in reductive iron assimilation and functional consequences during phagocytosis of Lichtheimia corymbifera, an emerging cause of mucormycosis. J Fungi (Basel) 7(4), 272.

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Blickensdorf M, Timme S, Figge MT (2020) Hybrid agent-based modeling of Aspergillus fumigatus infection to quantitatively investigate the role of Pores of Kohn in human alveoli. Front Microbiol 11, 1951.

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Böttcher B, Hoffmann B, Garbe E, Weise T, Cseresnyés Z, Brandt P, Dietrich S, Driesch D, Figge MT, Vylkova S (2020) The transcription factor Stp2 is important for Candida albicans biofilm establishment and sustainability. Front Microbiol 11, 794.

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Cseresnyes Z^*, Hassan MIA^*, Dahse HM, Voigt K, Figge MT; ^* shared first authors (2020) Quantitative impact of cell membrane fluorescence labeling on phagocytosis measurements in confrontation assays. Front Microbiol 11, 1193.

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Deinhardt-Emmer S, Rennert K, Schicke E, Cseresnyés Z, Windolph M, Nietzsche S, Heller R, Siwczak F, Haupt KF, Carlstedt S, Schacke M, Figge MT, Ehrhardt C, Löffler B, Mosig AS (2020) Co-infection with Staphylococcus aureus after primary influenza virus infection leads to damage of the endothelium in a human alveolus-on-a-chip model. Biofabrication 12(2), 025012.

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Figge MT (2020) Advances in quantitative bioimage analysis for proteins and cells. Cytometry Part A 97(4), 344-346. (Review)

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Gerst R, Medyukhina A, Figge MT (2020) MISA++: A standardized interface for automated bioimage analysis. SoftwareX 11, 100405.

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Hassan MIA, Kruse JM, Krüger T, Dahse HM, Cseresnyés Z, Blango MG, Slevogt H, Hörhold F, Ast V, König R, Figge MT, Kniemeyer O, Brakhage AA, Voigt K (2020) Functional surface proteomic profiling reveals the host heat-shock protein A8 as a mediator of Lichtheimia corymbifera recognition by murine alveolar macrophages. Environ Microbiol 22(9), 3722-3740.

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Marolda A, Hünniger K, Böttcher S, Vivas W, Löffler J, Figge MT, Kurzai O (2020) Candida species-dependent release of IL-12 by dendritic cells induces different levels of NK cell stimulation. J Infect Dis 221(12), 2060-2071.

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