(2011)
Automated image analysis of the host-pathogen interaction between phagocytes and Aspergillus fumigatus.
PLOS ONE 6(5),
e19591, *authors contributed equally.
Prof. Dr. Marc Thilo Figge
Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.deCurriculum vitae
Forschungsschwerpunkte
- Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
- Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bild- und Spektroskopiedaten
- Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
| seit 2021 | Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena |
| seit 2011 | Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI |
| 2011-2021 | Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena |
| 2005-2010 | Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt |
| 2001-2005 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL) |
| 2000 | Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL) |
| 1995 | Diplom in Physik an der Universität Dortmund |
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten
Auszeichnungen
| 2011 - 2017 | Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) |
Ämter und wissenschaftliche Aktivitäten
| seit 2023 | Vorstandsmitglied und Koordinator des Aufgabenbereichs “Bioimage Informatics” in der von der DFG geförderten nationalen Initiative zur Verwaltung von Forschungsdaten “NFDI4Bioimage” |
| seit 2023 | Vorstandsmitglied und PI in der DFG-Research Training School RTG 2723 – “Materials-Microbes-Microenvironments” |
| seit 2023 | Vorstandsmitglied des Beutenberg Campus e.V. “Life Science meets Physics” |
| seit 2023 | Herausgeber: PLOS Complex Systems |
| seit 2023 | Herausgeber: Biological Imaging |
| seit 2022 | Koordinator von Basic Technology 3 in dem vom BMBF geförderten “Leibniz Center for Photonics in Infection Research” |
| seit 2022 | Koordinator des vom BMBF geförderten "Multi-Model-Simulator Project” in der Förderlinie “Computational Life Sciences” |
| seit 2021 | Stellvertretender Koordinator der "Jena School for Microbial Communication" |
| seit 2019 | Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Sprecher und PI des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics" |
| seit 2019 | Herausgeber: Scientific Reports |
| seit 2017 | Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie |
| seit 2017 | PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget |
| seit 2017 | Herausgeber: Cytometry A |
| seit 2015 | Mitglied: Jena Center for Soft Matter |
| seit 2015 | Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science |
| seit 2014 | PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet |
| seit 2012 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB) |
| seit 2011 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI) |
| seit 2011 | Fakultätsmitglied und PI in der "International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions" |
| seit 2011 | Fakultätsmitglied und PI in der "Jena School for Microbial Communication" |
Publikationen
(2010)
Modelling cellular aggregation induced by chemotaxis and phototaxis.
Math Med Biol 27(4),
373-384.
(2010)
Toll-like receptor 4 signaling by follicular dendritic cells is pivotal for germinal center onset and affinity maturation.
Immunity 33(1),
84-95.
(2009)
Optimization of immunoglobulin substitution therapy by a stochastic immune response model.
PLOS ONE 4(5),
e5685.
(2009)
Modeling receptor-ligand binding kinetics in immunological synapse formation.
The European Physical Journal D 51(1),
153-160.
(2009)
Mathematical modeling of the circadian rhythm of key neuroendocrine-immune system players in rheumatoid arthritis: a systems biology approach.
Arthritis Rheum 60(9),
2585-2594.
(2009)
Germinal centres seen through the mathematical eye: B-cell models on the catwalk.
Trends Immunol 30(4),
157-164.
(2008)
Deriving a germinal center lymphocyte migration model from two-photon data.
J Exp Med 205(13),
3019-3029.
(2006)
Geometrically repatterned immunological synapses uncover formation mechanisms.
PLOS Comput Biol 2(11),
e171.
(2004)
Molecular dynamics simulation of nanoindentation
In: Computer simulation studies incondensed-matter physics XVI
pp. 250-255.Springer-Verlag, Berlin Heidelberg.
ISBN: 978-3-642-63923.
