(2025)
Rapid detection of microbial antibiotic susceptibility via deep learning supported analysis of angle-resolved scattered-light images of picoliter droplet cultivations.
Sens Actuators B Chem 424,
136866.
Prof. Dr. Marc Thilo Figge
Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.deCurriculum vitae
Forschungsschwerpunkte
- Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
- Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bild- und Spektroskopiedaten
- Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
| seit 2021 | Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena |
| seit 2011 | Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI |
| 2011-2021 | Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena |
| 2005-2010 | Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt |
| 2001-2005 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL) |
| 2000 | Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL) |
| 1995 | Diplom in Physik an der Universität Dortmund |
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten
Auszeichnungen
| 2011 - 2017 | Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) |
Ämter und wissenschaftliche Aktivitäten
| seit 2023 | Vorstandsmitglied und Koordinator des Aufgabenbereichs “Bioimage Informatics” in der von der DFG geförderten nationalen Initiative zur Verwaltung von Forschungsdaten “NFDI4Bioimage” |
| seit 2023 | Vorstandsmitglied und PI in der DFG-Research Training School RTG 2723 – “Materials-Microbes-Microenvironments” |
| seit 2023 | Vorstandsmitglied des Beutenberg Campus e.V. “Life Science meets Physics” |
| seit 2023 | Herausgeber: PLOS Complex Systems |
| seit 2023 | Herausgeber: Biological Imaging |
| seit 2022 | Koordinator von Basic Technology 3 in dem vom BMBF geförderten “Leibniz Center for Photonics in Infection Research” |
| seit 2022 | Koordinator des vom BMBF geförderten "Multi-Model-Simulator Project” in der Förderlinie “Computational Life Sciences” |
| seit 2021 | Stellvertretender Koordinator der "Jena School for Microbial Communication" |
| seit 2019 | Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Sprecher und PI des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics" |
| seit 2019 | Herausgeber: Scientific Reports |
| seit 2017 | Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie |
| seit 2017 | PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget |
| seit 2017 | Herausgeber: Cytometry A |
| seit 2015 | Mitglied: Jena Center for Soft Matter |
| seit 2015 | Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science |
| seit 2014 | PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet |
| seit 2012 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB) |
| seit 2011 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI) |
| seit 2011 | Fakultätsmitglied und PI in der "International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions" |
| seit 2011 | Fakultätsmitglied und PI in der "Jena School for Microbial Communication" |
Publikationen
(2024)
The proteomic response of Aspergillus fumigatus to Amphotericin B (AmB) reveals the involvement of the RTA-like protein RtaA in AmB resistance.
microLife
[Accepted]
(2024)
Organ-on-chip models for infectious disease research.
Nat Microbiol 9(4),
891-904.
(Review)
(2024)
Engineering adhesion of the probiotic strain Escherichia coli nissle to the fungal pathogen Candida albicans.
ACS Synth Biol
[Epub ahead of print]
(2024)
Selective uptake into inflamed human intestinal tissue and immune cell targeting by wormlike polymer micelles.
Small 20(21),
2470162.
(2024)
Aspergillus fumigatus-derived gliotoxin impacts innate immune cell activation through modulating lipid mediator production in macrophages.
Immunology 173(4),
748-767.
(2024)
The spatial organization of sphingofungin biosynthesis in Aspergillus fumigatus and its cross-interaction with sphingolipid metabolism.
mBio 15(3),
e0019524.
(2024)
Modeling of intravenous caspofungin administration using an intestine-on-chip reveals altered Candida albicans microcolonies and pathogenicity.
Biomaterials 307,
122525.
(2024)
Metamizole outperforms meloxicam in sepsis: insights on analgesics, survival and immunomodulation in the peritoneal contamination and infection sepsis model.
Front Immunol 15,
1432307.
(2024)
NFDI4BIOIMAGE - National research data infrastructure for microscopy and bioimage analysis.
Zenodo ,
10.3389/fimmu.2024.1432307.
