Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte
  • Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
  • Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bild- und Spektroskopiedaten
  • Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
seit 2011 Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI
2011-2021 Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena
2005-2010 Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt
2001-2005 Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL)
2000 Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL)
1995 Diplom in Physik an der Universität Dortmund
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten

Auszeichnungen

2011 - 2017 Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS)

Ämter und wissenschaftliche Aktivitäten

seit 2023 Vorstandsmitglied und Koordinator des Aufgabenbereichs “Bioimage Informatics” in der von der DFG geförderten nationalen Initiative zur Verwaltung von Forschungsdaten “NFDI4Bioimage”
seit 2023 Vorstandsmitglied und PI in der DFG-Research Training School RTG 2723 – “Materials-Microbes-Microenvironments”
seit 2023 Vorstandsmitglied des Beutenberg Campus e.V. “Life Science meets Physics”
seit 2023 Herausgeber: PLOS Complex Systems
seit 2023 Herausgeber: Biological Imaging
seit 2022 Koordinator von Basic Technology 3 in dem vom BMBF geförderten “Leibniz Center for Photonics in Infection Research”
seit 2022 Koordinator des vom BMBF geförderten "Multi-Model-Simulator Project” in der Förderlinie “Computational Life Sciences”
seit 2021 Stellvertretender Koordinator der "Jena School for Microbial Communication"
seit 2019 Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Sprecher und PI des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics"
seit 2019 Herausgeber: Scientific Reports
seit 2017 Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie
seit 2017 PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget
seit 2017 Herausgeber: Cytometry A
seit 2015 Mitglied: Jena Center for Soft Matter
seit 2015 Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science
seit 2014 PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet
seit 2012 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB)
seit 2011 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI)
seit 2011 Fakultätsmitglied und PI in der "International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions"
seit 2011 Fakultätsmitglied und PI in der "Jena School for Microbial Communication"

Publikationen

Alonso-Roman R, Mosig AS, Figge MT, Papenfort K, Eggeling C, Schacher FH, Hube B, Gresnigt MS (2024) Organ-on-chip models for infectious disease research. Nat Microbiol ,
Jojić K*, Gherlone F*, Cseresnyés Z, Bissell AU, Hoefgen S, Hoffmann S, Huang Y, Janevska S, Figge MT, Valiante V (2024) The spatial organization of sphingofungin biosynthesis in Aspergillus fumigatus and its cross-interaction with sphingolipid metabolism. mBio 15(3), e0019524.
Kaden T, Alonso-Roman R, Akbarimoghaddam P, Mosig AS, Graf K, Raasch M, Hoffmann B, Figge MT, Hube B, Gresnigt MS (2024) Modeling of intravenous caspofungin administration using an intestine-on-chip reveals altered Candida albicans microcolonies and pathogenicity. Biomaterials 307, 122525.
Ruhland E, Siemers M*, Gerst R*, Späth F, Vogt LN, Figge MT, Papenfort K, Fröhlich KS# (2024) The global RNA–RNA interactome of Klebsiella pneumoniae unveils a small RNA regulator of cell division. Proc Natl Acad Sci U S A 121(9), e2317322121.
Valentine M*, Rudolph P*, Dietschmann A, Tsavou A, Mogavero S, Lee S, Priest EL, Zhurgenbayeva G, Jablonowski N, Timme S, Eggeling C, Allert S, Dolk E, Naglik JR, Figge MT, Gresnigt MS*#, Hube B*# (2024) Nanobody-mediated neutralization of candidalysin prevents epithelial damage and inflammatory responses that drive vulvovaginal candidiasis pathogenesis. mBio 15(3), e0340923.
Battista M, Hoffmann B, Bachelot Y, Zimmermann L, Teuber L, Jost A, Linde S, Westermann M, Müller MM, Slevogt H, Hammerschmidt S, Figge MT, Vilhena C*#, Zipfel PF*# (2023) The role of pneumococcal extracellular vesicles on the pathophysiology of the kidney disease hemolytic uremic syndrome. mSphere 8(4), e0014223.
Behrendt F, Pretzel D, Cseresnyés Z, Kleinsteuber M, Wloka T, Radosa L, Figge MT, Gottschaldt M, Brakhage AA, Schubert US# (2023) Hydrophilic cryogels as potential 3D cell culture materials: Synthesis and characterization of 2-(methacrylamido) glucopyranose-based polymer scaffolds. J Polym Sci 61(23), 3039-3054.
Behrendt F*, Cseresnyés Z*, Gerst R, Gottschaldt M, Figge MT#, Schubert US# (2023) Evaluation of reproducible cryogel preparation based on automated image analysis using deep learning. J Biomed Mater Res A 111(11), 1734-1749.
Dellbrügge F, Jesse LD, Medyukhina A, Liu N, Neugebauer S, Freißmuth M, Höppener S, Figge MT, Morrison H, Riecken LB, Press AT# (2023) Contribution of radixin and ezrin to the maintenance of hepatocytes' excretory function in health and disease. Heliyon 9(11), e21009.
Foo WL, Cseresnyés Z, Rössel C, Teng Y, Ramoji A, Chi M, Hauswald W, Huschke S, Hoeppener S, Popp J, Schacher FH, Sierka M, Figge MT, Press AT#, Bauer M# (2023) Tuning the corona-core ratio of polyplex micelles for selective oligonucleotide delivery to hepatocytes or hepatic immune cells. Biomaterials 294, 122016.

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