Synthetische Ökologie

Durch die Anwendung von Technologien im Genom-Maßstab in der industriellen Biotechnologie, sowohl experimentell als auch in silico, war es möglich, die Umwandlung von Ausgangsmaterial aus Biomasse zu Chemikalien, Materialien und Brennstoffen durch mikrobielle Fermentation zu verbessern. Unsere Gruppe wendet Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologien an, um die zugrunde liegenden molekularen Mechanismen für eine verbesserte Nutzung der Kohlenstoffquelle, eine erhöhte Produktbildung und Stresstoleranz zu finden. Wir verwenden hauptsächlich Saccharomyces cerevisiae und Aspergilli als Zellfabriken für Moleküle mit hoher Wertschöpfung und integrieren OMICS Daten mit Flussbilanzanalyse zur Kartierung industriell relevanter Genotyp-Phänotyp-Verbindungen, einschließlich der Nutzung der natürlichen Vielfalt bei natürlichen Isolaten oder Kreuzungen zwischen Isolaten, klassischer Mutagenese und evolutionärer Technik. Derzeit arbeitet unsere Gruppe an der effizienten Nutzung der funktionellen Optimierung von Bakterien und Pilzen, die es ermöglichen würde, komplexe, sichere und erfolgreiche klinische Anwendungen von Mikroorganismen zu entwickeln, insbesondere für die Herstellung von in-situ Verbindungen im menschlichen Darm. Die Wirksamkeit lebender Mikroorganismen bei der Prävention und Behandlung von Krankheiten wurde von Wissenschaft und Industrie umfassend untersucht. Trotz der oft widersprüchlichen Schlussfolgerungen für ihre prophylaktischen und therapeutischen Gesundheitsindikationen bei der Anwendung von Mikroorganismen, die bestimmte Metaboliten überproduzieren, die die Immunhomöostase wiederherstellen oder die effizientesten synthetischen Gemeinschaften zur Bekämpfung von Bauchinfektionen bilden,  liegt  ein großes Potenzial vor, solange wir die Qualität der Evidenz und die Regularien ihrer Anwendung verbessern. Wir konzentrieren uns auf das Verständnis der mikrobiellen Stoffwechselzusammenhänge für die Entwicklung eines computergestützten Frameworks, dass die Gestaltung von mikrobiomtechnischen, prophylaktischen und therapeutischen Maßnahmen ermöglicht.