(2020)
Co-infection with Staphylococcus aureus after primary influenza virus infection leads to damage of the endothelium in a human alveolus-on-a-chip model.
Biofabrication 12(2),
025012.

Prof. Dr. Marc Thilo Figge
Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.deCurriculum vitae
Forschungsschwerpunkte
- Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
- Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
- Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 | Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena |
seit 2011 | Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI |
2011-2021 | Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena |
2005-2010 | Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt |
2001-2005 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL) |
2000 | Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL) |
1995 | Diplom in Physik an der Universität Dortmund |
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten
Auszeichnungen
2011 - 2017 | Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) |
Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen
seit 2021 | Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication |
seit 2019 | Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
seit 2019 | Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
seit 2019 | Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics" |
seit 2019 | Herausgeber: Scientific Reports |
seit 2017 | Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie |
seit 2017 | PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget |
seit 2017 | Herausgeber: Cytometry A |
seit 2015 | Mitglied: Jena Center for Soft Matter |
seit 2015 | Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science |
seit 2014 | PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet |
seit 2014 | Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine |
seit 2012 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB) |
seit 2011 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI) |
seit 2011 | Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions |
seit 2011 | Mitglied: Jena School for Microbial Communication |
Publikationen
(2020)
Advances in quantitative bioimage analysis for proteins and cells.
Cytometry Part A 97(4),
344-346.
(Review)
(2020)
MISA++: A standardized interface for automated bioimage analysis.
SoftwareX 11,
100405.
(2020)
Functional surface proteomic profiling reveals the host heat-shock protein A8 as a mediator of Lichtheimia corymbifera recognition by murine alveolar macrophages.
Environ Microbiol 22(9),
3722-3740.
(2020)
Candida species-dependent release of IL-12 by dendritic cells induces different levels of NK cell stimulation.
J Infect Dis 221(12),
2060-2071.
(2020)
DeconvTest: Simulation framework for quantifying errors and selecting optimal parameters of image deconvolution.
J Biophotonics 13(4),
e201960079.
(2020)
Dynamic spherical harmonics approach for shape classification of migrating cells.
Sci Rep 10(1),
6072.
(2020)
Staphylococcus aureus lung infection results in down-regulation of surfactant protein-A mainly caused by pro-inflammatory macrophages.
Microorganisms 8(4),
577.
(2020)
Flotillin-dependent lipid-raft microdomains are required for functional phagolysosomes against fungal infections.
Cell Rep 32(7),
108017.
(2020)
Human neutrophils produce antifungal extracellular vesicles against Aspergillus fumigatus.
mBio 11(2),
e00596-20.