(2017)
Mast cells acquire MHCII from dendritic cells during skin inflammation.
J Exp Med 214(12),
3791-3811.
Prof. Dr. Marc Thilo Figge
Angewandte Systembiologie · Abteilungsleiter +49 3641 532-1416 thilo.figge@leibniz-hki.deCurriculum vitae
Forschungsschwerpunkte
- Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
- Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bild- und Spektroskopiedaten
- Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
| seit 2021 | Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena |
| seit 2011 | Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI |
| 2011-2021 | Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena |
| 2005-2010 | Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt |
| 2001-2005 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL) |
| 2000 | Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL) |
| 1995 | Diplom in Physik an der Universität Dortmund |
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten
Auszeichnungen
| 2011 - 2017 | Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) |
Ämter und wissenschaftliche Aktivitäten
| seit 2023 | Vorstandsmitglied und Koordinator des Aufgabenbereichs “Bioimage Informatics” in der von der DFG geförderten nationalen Initiative zur Verwaltung von Forschungsdaten “NFDI4Bioimage” |
| seit 2023 | Vorstandsmitglied und PI in der DFG-Research Training School RTG 2723 – “Materials-Microbes-Microenvironments” |
| seit 2023 | Vorstandsmitglied des Beutenberg Campus e.V. “Life Science meets Physics” |
| seit 2023 | Herausgeber: PLOS Complex Systems |
| seit 2023 | Herausgeber: Biological Imaging |
| seit 2022 | Koordinator von Basic Technology 3 in dem vom BMBF geförderten “Leibniz Center for Photonics in Infection Research” |
| seit 2022 | Koordinator des vom BMBF geförderten "Multi-Model-Simulator Project” in der Förderlinie “Computational Life Sciences” |
| seit 2021 | Stellvertretender Koordinator der "Jena School for Microbial Communication" |
| seit 2019 | Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse" |
| seit 2019 | Sprecher und PI des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics" |
| seit 2019 | Herausgeber: Scientific Reports |
| seit 2017 | Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie |
| seit 2017 | PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget |
| seit 2017 | Herausgeber: Cytometry A |
| seit 2015 | Mitglied: Jena Center for Soft Matter |
| seit 2015 | Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science |
| seit 2014 | PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet |
| seit 2012 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB) |
| seit 2011 | Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI) |
| seit 2011 | Fakultätsmitglied und PI in der "International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions" |
| seit 2011 | Fakultätsmitglied und PI in der "Jena School for Microbial Communication" |
Publikationen
(2017)
Systems Biology of Infection.
In: NOVA ACTA LEOPOLDINA (ed.) Crossing Boundaries in Science.
Documentation of the Workshop of the German National Academy of Sciences Leopoldina, Weimar, 06/30/2016-07/02/2016, 419, pp. 45-51.Wissenschaftliche Verlagsgesellschaft Stuttgart, Halle (Saale).
ISBN: 978-3-8047-3758. (Review)
(2017)
Fully automated evaluation of total glomerular number and capillary tuft size in murine nephritic kidneys using lightsheet microscopy.
J Am Soc Nephrol 28(2),
452-459.
(2017)
Dimensionality of motion and binding valency govern receptor-ligand kinetics as revealed by agent-based modeling.
Front Immunol 8,
1692.
(2017)
Segmentation of clusters by template rotation expectation maximization.
Comput Vis Image Underst 152,
64-72.
(2017)
Quantification of arthritic bone degradation by analysis of 3D micro-computed tomography data.
Sci Rep 7,
44434.
(2016)
FHR3 Blocks C3d-Mediated Coactivation of Human B Cells.
J Immunol 197(2),
620-629.
(2016)
Deciphering the counterplay of Aspergillus fumigatus infection and host inflammation by evolutionary games on graphs.
Sci Rep 6,
27807.
(2015)
Automated segmentation and tracking of non-rigid objects in time-lapse microscopy videos of polymorphonuclear neutrophils.
Medical Image Analysis 20(1),
34-51.
(2015)
Neutrophil activation by Candida glabrata but not Candida albicans promotes fungal uptake by monocytes.
Cell Microbiol 17(9),
1259-1276.
