Curriculum vitae

Forschungsschwerpunkte
  • Wirt-Pathogen Interaktion bei humanpathogenen Pilzen
  • Automatisierte Verarbeitung mikroskopischer Bilddaten
  • Raumzeitliche Computersimulationen agentenbasierter Infektionsmodelle
Wissenschaftlicher Werdegang
seit 2021 Professor (W3) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
seit 2011 Leiter der Forschungsruppe Angewandte Systembiologie am Leibniz-HKI
2011-2021 Professor (W2) für Angewandte Systembiologie, Friedrich-Schilller-Universität Jena
2005-2010 Junior Fellow in Theoretische Immunologie am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) der Goethe Universität Frankfurt
2001-2005 Wissenschaftlicher Mitarbeiter in Computerphysik an der Universität Groningen (NL)
2000 Dr. rer. nat. in Physik an der Universität Groningen (NL)
1995 Diplom in Physik an der Universität Dortmund
Auszeichnungen · Ämter · wissenschaftliche Aktivitäten

Auszeichnungen

2011 - 2017 Adjunct Fellow am Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS)

Wissenschaftliche Aktivitäten und Funktionen

seit 2021 Stellvertretender Koordinator der Jena School for Microbial Communication
seit 2019 Koordinator der Research Area C - Data Synopsis im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Mitglied des Management Boards des Microverse Imaging Center im Exzellenzcluster "Balance of the Microverse"
seit 2019 Sprecher des Leibniz-WissenschaftsCampus "InfectoOptics"
seit 2019 Herausgeber: Scientific Reports
seit 2017 Ombudsperson am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie
seit 2017 PI und Mitglied des DFG-Collaborative Research Center 1278 PolyTarget
seit 2017 Herausgeber: Cytometry A
seit 2015 Mitglied: Jena Center for Soft Matter
seit 2015 Mitglied: Michael Stifel Center for Data-Driven and Simulation Science
seit 2014 PI und Mitglied im DFG-Collaborative Research Center 124 FungiNet
seit 2014 Herausgeber: Computational and Mathematical Models in Medicine
seit 2012 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium "Image-based Systems Biology" (IbSB)
seit 2011 Organisator: Zweijährliches internationales Symposium über "Systems Biology of Microbial Infection" (SBMI)
seit 2011 Mitglied: International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions
seit 2011 Mitglied: Jena School for Microbial Communication

Publikationen

Hassan MIA, Kruse JM, Krüger T, Dahse HM, Cseresnyés Z, Blango MG, Slevogt H, Hörhold F, Ast V, König R, Figge MT, Kniemeyer O, Brakhage AA, Voigt K (2020) Functional surface proteomic profiling reveals the host heat-shock protein A8 as a mediator of Lichtheimia corymbifera recognition by murine alveolar macrophages. Environ Microbiol 22(9), 3722-3740.
Marolda A, Hünniger K, Böttcher S, Vivas W, Löffler J, Figge MT, Kurzai O (2020) Candida species-dependent release of IL-12 by dendritic cells induces different levels of NK cell stimulation. J Infect Dis 221(12), 2060-2071.
Medyukhina A, Figge MT (2020) DeconvTest: Simulation framework for quantifying errors and selecting optimal parameters of image deconvolution. J Biophotonics 13(4), e201960079.
Medyukhina A*, Blickensdorf M*, Cseresnyés Z, Ruef N, Stein JV, Figge MT; * authors contributed equally (2020) Dynamic spherical harmonics approach for shape classification of migrating cells. Sci Rep 10(1), 6072.
Schicke E, Cseresnyes Z, Rennert K, Vau V, Haupt KF, Hornung F, Nietzsche S, Swiczak F, Schmidtke M, Koch M, Glück B, Schacke M, Heller R, Mosig AS, Figge MT, Ehrhardt C, Löffler B, Deinhardt-Emmer S (2020) Staphylococcus aureus lung infection results in down-regulation of surfactant protein-A mainly caused by pro-inflammatory macrophages. Microorganisms 8(4), 577.
Schmidt F, Thywißen A, Goldmann M, Cunha C, Cseresnyés Z, Schmidt H, Rafiq M, Galiani S, Gräler MH, Chamilos G, Lacerda JF, Campos Jr A, Eggeling C, Figge MT, Heinekamp T, Filler SG, Carvalho A, Brakhage AA (2020) Flotillin-dependent lipid-raft microdomains are required for functional phagolysosomes against fungal infections. Cell Rep 32(7), 108017.
Shopova IA, Belyaev I, Dasari P, Jahreis S, Stroe MC, Cseresnyés Z, Zimmermann AK, Medyukhina A, Svensson C-M, Krüger T, Szeifert V, Nietzsche S, Conrad T, Blango MG, Kniemeyer O, von Lilienfeld-Toal M, Zipfel PF, Ligeti E, Figge MT, Brakhage AA (2020) Human neutrophils produce antifungal extracellular vesicles against Aspergillus fumigatus. mBio 11(2), e00596-20.
Sreekantapuram S*, Lehnert T*, Prauße MTE, Berndt A, Berens C, Figge MT**, Jacobsen ID**; * authors contributed equally; ** corresponding authors (2020) Dynamic interplay of host and pathogens in an avian whole blood model. Front Immunol 11, 500.
Tille A, Lehnert T, Zipfel PF, Figge MT (2020) Quantification of factor H mediated self versus non-self discrimination by mathematical modeling. Front Immunol 11, 1911.
Al-Zaben N*, Medyukhina A*, Dietrich S, Marolda A, Hünniger K, Kurzai O, Figge MT; *authors contributed equally (2019) Automated tracking of label-free cells with enhanced recognition of whole tracks. Sci Rep 9(1), 3317.